我国重点治理的三湖是：

1、太湖：中国五大淡水湖之一，孕育了繁荣发达的苏南地区。到2017年，是太湖治污的第十个年头，水质总体上已好于1997年以前的水平，并保持了稳中向好态势。

2、滇池：云南省最大的淡水湖，有高原明珠之称。从上世纪90年代中期开始，在国家的支持下，云南省、昆明市一直在下大力气不懈地治理滇池，已经取得了一定成效。

3、巢湖：我国五大淡水湖之一，也是我国湖泊污染治理的重中之重，预计要到2035年时，巢湖的生态环境才会得到根本性的好转。