小蘑菇主要讲一只偶然成为异种变成人类的小蘑菇到人类基地寻找自己的孢子，并见证人类在巨大危难前努力生存，到人类即将灭亡再到人类与世界和谐薪火相传的故事。故事发生的时间很近，十几年后地球磁场莫名消失，物种变异，其它生物可与人类基因相融并越来越强于人类，人类靠着人造磁场建造人类基地和地下城在这个世界生存下来。

当灭绝的物种以一种变异的方式回归，当被烈火吞噬的森林变成高大恐怖的恶魔，当沙漠化的土地变得会吃人。人类应该认识到自然的力量，我们需要保护自然，热爱这个美丽的世界，一如热爱我们人类自身。从这本书中我们可以感受到强烈的悲剧美。无论是地磁消失后异变的地球，还是一直在坚持的人类基地，都可以展现出悲剧的力量和信念。